nii.gz格式是医学图像常用的压缩格式，python中可用nibabel和sitk来读取保存。
使用nibabel
由于使用nibabel图像会旋转90度，所以读取保存的时候还得保存映射信息，3维图像格式为（z, y, x）
读取nii.gz文件
img = nib.load('xxxxx.nii.gz')
img_affine = img.affine
img = img.get_data()
保存nii.gz文件
nib.Nifti1Image(img,img_affine).to_filename('xxxxx.nii.gz')
使用sitk
使用sitk读取nii时，读取出来的还是图片格式，可以使用他自带的函数进行处理，不过速度比较慢，建议使用GetArrayFromImage转换成numpy格式再处理，3维图像格式为（x, y, z）
读取nii.gz文件
img = sitk.ReadImage('xxxxx.nii.gz')
img = sitk.GetArrayFromImage(img)
保存nii.gz文件
out = sitk.GetImageFromArray(img)
sitk.WriteImage(out,'xxxxx.nii.gz')
在numpy数组和nibabel或sitk中相互转换时，要注意数据的格式，一般保存为int或uint类型。比如输入nii为16位有符号整型时，我们可能需要转换成0~255灰度图，可用如下代码：
img = sitk.ReadImage('xxxxx.nii.gz')
img = sitk.Cast(sitk.RescaleIntensity(img),sitk.sitkUInt8)
img = sitk.GetArrayFromImage(img)
补充知识：SimpleITK保存Nii文件与错误处理方式
Reason:
把处理好的分割结果保存为nii文件，用ITKsnap读取时出现了如下错误。
SimpleITK读取和保存Nii文件
1. 读取
import SimpleITK as sitk filename = './xxx.nii' ct = sitk.ReadImage(filename) ct_array = sitk.GetArrayFromImage(ct) origin =ct.GetOrigin() direction = ct.GetDirection() space = ct.GetSpacing()
2. 保存
savedImg = sitk.GetImageFromArray(ct_array) savedImg.SetOrigin(origin) savedImg.SetDirection(direction) savedImg.SetSpacing(space) sitk.WriteImage(savedImg, saved_name)
Note：被保存的ct_array数组一定是ndarray，float类型的才能被ITKsnap正确读取，如果是int类型的，就会出现上图中的错误。
以上这篇python使用nibabel和sitk读取保存nii.gz文件实例就是小编分享给大家的全部内容了，希望能给大家一个参考，也希望大家多多支持。
《魔兽世界》大逃杀！60人新游玩模式《强袭风暴》3月21日上线
暴雪近日发布了《魔兽世界》10.2.6 更新内容，新游玩模式《强袭风暴》即将于3月21 日在亚服上线，届时玩家将前往阿拉希高地展开一场 60 人大逃杀对战。
艾泽拉斯的冒险者已经征服了艾泽拉斯的大地及遥远的彼岸。他们在对抗世界上最致命的敌人时展现出过人的手腕，并且成功阻止终结宇宙等级的威胁。当他们在为即将于《魔兽世界》资料片《地心之战》中来袭的萨拉塔斯势力做战斗准备时，他们还需要在熟悉的阿拉希高地面对一个全新的敌人──那就是彼此。在《巨龙崛起》10.2.6 更新的《强袭风暴》中，玩家将会进入一个全新的海盗主题大逃杀式限时活动，其中包含极高的风险和史诗级的奖励。
《强袭风暴》不是普通的战场，作为一个独立于主游戏之外的活动，玩家可以用大逃杀的风格来体验《魔兽世界》，不分职业、不分装备（除了你在赛局中捡到的），光是技巧和战略的强弱之分就能决定出谁才是能坚持到最后的赢家。本次活动将会开放单人和双人模式，玩家在加入海盗主题的预赛大厅区域前，可以从强袭风暴角色画面新增好友。游玩游戏将可以累计名望轨迹，《巨龙崛起》和《魔兽世界：巫妖王之怒 经典版》的玩家都可以获得奖励。
更新日志
- 孙悦.1996-伙伴【正大国际】【ＷAV+CUE】
- 纪钧瀚《钢琴阅读时光 雨中书店聆听轻音乐》[FLAC/分轨][399.62MB]
- 证声音乐图书馆《走向自然 疗心爵士乐》[320K/MP3][87.4MB]
- 证声音乐图书馆《走向自然 疗心爵士乐》[FLAC/分轨][184.94MB]
- 陈慧娴.2018-Priscilla-Ism演唱会3CD（2024环球红馆40复刻系列）【环球】【WAV+CUE】
- 郑秀文.1999-我应该得到（国）【华纳】【WAV+CUE】
- 陈家慧.2011-钢琴酒吧2CD【龙吟唱片】【WAV+CUE】
- 证声音乐图书馆《雨季 蓝调吉他 Rainy Blues》[320K/MP3][45.01MB]
- 证声音乐图书馆《雨季 蓝调吉他 Rainy Blues》[FLAC/分轨][109.13MB]
- 赞多《序章》[320K/MP3][45.54MB]
- 许巍.2004-每一刻都是崭新的【步升大风】【WAV+CUE】
- 群星.2024-四方馆影视原声带【韶愔音乐】【FLAC分轨】
- 陈雷.1997-安锁咧【金圆唱片】【WAV+CUE】
- 关淑怡.2013-MY.FAVORITE.SK.3CD【环球】【WAV+CUE】
- Sweety.2006-花言乔语【丰华】【WAV+CUE】